La seconda fase della spedizione (1°gennaio - 30 dicembre 1829)
Champollion,è ora in grado di pianificare le tappe del suo graduale rientro ad Alessandria per il 1829,la missione inizia presso Serra e Gebel,Adda e scava lo speos di Maschakit,poi Abu Simbel,Ibrim,Derr,Amada,Maharraka,Dakka,Girsché Hassan.Poi Dendur e Kalabsha,a File e Assuan vi resta per un pò per documentare il complesso di Elefantina.Poi missione a Kom Ombo e Gebel Sisila per lo speos di Amenhotep III.
A Edfu,Elkab-Elethya,poi Esna Ermant.
Poi nei giorni Champollion documenta il Ramesseum,a Karnak documenta il vasto complesso.
man mano a Dendera,Abido e Antinoe.
Per due mesila missione documenta 18 tombe reali,come quelle di Merenptah,Ramesse III,Ramesse V-VI,Ramesse IX,Amenemes,Tauseret,Amenhotep III,Ramesse I e Sethi I.
Dopo due mesi il lavoro di missione prosegue nella valle delle regine.
Poi il 20 giugno 1829 Champollion è a Medinet Habu per documentare il tempio funerario di Ramesse III e dei templi di epoca tarda.